Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LHX3Q9UBR4 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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