Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FANCFQ9NPI8 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms