Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSNK2A3Q8NEV1 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms