Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP6Q3SY56 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms