Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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