Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SCN9AQ15858 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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