Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms