Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms