Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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ATP1A4Q13733 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ATP1A4Q13733 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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