Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SMAD4Q13485 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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