Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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