Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED3Q96IU2 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
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