Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LAMA3Q16787 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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