Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FXNQ16595 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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