Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TAF1AQ15573 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TAF1AQ15573 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms