Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SS18Q15532 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms