Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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TTF1Q15361 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTF1Q15361 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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