Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATRQ13535 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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