Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXE3Q13461 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXE3Q13461 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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