Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PDE3BQ13370 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms