Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PTPRDP23468 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRDP23468 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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