Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VEGFDO43915 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms