Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KCNS3Q9BQ31 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms