Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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TRERF1Q96PN7 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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TRERF1Q96PN7 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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