Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
FSCN1Q16658 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FSCN1Q16658 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms