Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NRF1Q16656 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NRF1Q16656 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NRF1Q16656 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms