Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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SGCBQ16585 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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