Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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