Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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CCDC85BQ15834 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC85BQ15834 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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