Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SIX1Q15475 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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