Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NCAPHQ15003 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms