Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDE1CQ14123 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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