Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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COL4A6Q14031 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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COL4A6Q14031 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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COL4A6Q14031 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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COL4A6Q14031 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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