Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CBX3Q13185 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CBX3Q13185 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CBX3Q13185 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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