Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
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