Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRBP23467 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRBP23467 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRBP23467 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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