Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms