Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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