Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms