Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ATP6AP1Q15904 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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