Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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HERC1Q15751 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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HERC1Q15751 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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