Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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