Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IHHQ14623 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
IHHQ14623 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
IHHQ14623 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
IHHQ14623 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms