Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF235Q14590 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms