Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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PRDM2Q13029 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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PRDM2Q13029 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
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PRDM2Q13029 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
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PRDM2Q13029 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PRDM2Q13029 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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