Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNEQ04844 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms