Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRMP28827 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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PTPRMP28827 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRMP28827 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRMP28827 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRMP28827 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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PTPRMP28827 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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PTPRMP28827 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRMP28827 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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