Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm3550W4VSN7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms