Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms