Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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